中国科学院数学与系统科学研究院图书馆，其馆藏中的一部分由院拨来原中央研究院数学所藏书，另一部分是国内外知名数学家的捐赠，其它藏书均为建馆后陆续向国内外定购的。成为国内藏书较全的数学专业图书馆。但图书馆却完整地保留了下来，归属于现在的数学所，图书资源为三所共同使用。三个研究所和数学所各级领导始终予以高度的重视，在图书经费和管理人员等方面都尽量给予保障。经由院出版委及基础局领导，1994年9月成立了三所数学图书协调小组(不包括计算数学所)， 协调图书期刊经费的使用比例和书刊的订购范围，数学所图书馆作为中心馆得到了更多的经费支持。向京区数学口、其他单位及全国数学界开展开放的数学文献服务工作。1998年复印量就达13万张。不仅保证着我院数学所、系统科学所及应用数学所的研究需要，而且为全国各单位提供数学资料的查询和复印，享誉国内和东南亚各国。外文书刊占84.5%。并有全套数学黄皮书！！等换取了许多国外数学核心刊物。