北京市卫生监督所的主要职责是，依法监督管理食品，消毒产品，生活饮用水及涉及饮用水卫生安全产品，依法监督管理公共场所，职业，放射，学校卫生等工作，依法监督传染病防治工作，依法监督医疗机构和采供血机构及其执业人员的执业活动，整顿和规范医疗服务市场，打击非法行医和非法采供血行为，承担法律法规规定的其他职责。2005年9月开始，承担市卫生局卫生监督处相关职能政府网站，北京市卫生监督所，www.bjhi.gov.cn，北京市卫生监督所成立于2000年6月30日，2005年核定编制155人，领导职数1正3副，2005年6月成立党委，设专职书记1人，副书记1人，兼职副书记1人。所内现有职工164人（男83人，女81人），其中，专业技术人员152人，正高级职称3人，副高级职称20人，中级职称61人，初级职称51人。现有博士研究生学历1人，硕士研究生学历8人，本科生93人，大专生37人，中专生14人。现设5个职能科室（办公室，党办工团，人保科，财务科，总务科）和9个业务科室（卫生监督一科，卫生监督二科，卫生执法监督信息中心，法规督察科，应急执法指挥中心，卫生许可受理审核中心，大型活动保障中心，监督执法一队，监督执法二队）