花垣县县级建制始于明洪武三十年（1397），置镇溪军民千户所，分镇溪崇山124寨为十里，自高岩河分界，下四里为今吉首地，上六里为今花垣县域，旧称 “六里苗地 ”。清雍正八年（1730），设六里同知，雍正十年改六里为永绥厅，治吉卫吉多坪。嘉庆二年（1797），升永绥厅为直隶厅。嘉庆七年，厅治迁花垣（今县城）。民国元年（1912），改直隶厅为行政厅。次年，改永绥厅为永绥县。属辰沅道。民国24年属湘西绥靖处。民国25年属湖南省第四行政督察区：民国29年属第九行政督察区。1949年11月和平解放，同时成立县人民政府，治花垣。属沅陵专区，1952年改属湘西苗族自治区。1953年9月，永绥县改名花垣县。辖地、治所不变。1955年属湘西苗族自治州。1957年属湘西土家族苗族自治州。至1995年，全县辖7镇14乡，16个居委会、299个村、2,045个村民小组。7镇即花垣、团结、民乐、龙潭、吉卫、茶洞、麻栗场。14乡即大河坪、长乐、窝勺、猫儿、补抽、雅酉、董马库、道二、雅桥、排吾、排碧、排料、大龙洞、两河。

花垣县位于湘西州西北部，东接保靖、吉首，南连凤凰，西邻贵州松桃、重庆秀山，北近保靖毛沟、清水、复兴、水田等地。南北长49.5公里，东西宽38.5公里，总面积1,108.69平方公里。其中耕地面积17.40千公顷（1995年末实有），含水田10.12千公顷，旱地7.28千公顷。东经109 deg;15 prime;～109 deg;38 prime;，北纬28 deg;10 prime;～28 deg;38 prime;。地势东南西三面高，北部低，中部缓呈三级台阶状，近似一把围椅。最高海拔1197米，最低海拔212米。境内年均气温为13℃～17℃ ，年降水量1418毫米，无霜期245～280天。日照时数，西北为1,200～1,400小时，中部为950～990小时，东南为1.010～1.060小时。境内土壤以水稻土、黑色灰土、红色灰土、红壤土、黄壤土为主，共5类，13亚类，44土属，144土种。

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