医院专业设置齐全，共有43个临床医技科室，2010年和2011年先后有5个专科被确定为国家临床重点专科，包括：新生儿、重症医学科、小儿消化科、中医儿科和新生儿疾病重点实验室等。新生儿、外科、心血管、传染病等专业曾先后被列为卫生部临床学科重点专业，新生儿科是上海市医学重点学科，小儿外科是上海市小儿外科疑难重症临床医学中心，呼吸急救专业是上海市医学领先专业。

医院服务宗旨：一切为了孩子。医院使命：建树医学典范，呵护儿童健康。医院定位：立足上海、服务全国、辐射亚洲。医院的愿景：亚洲一流的儿童医学中心，儿科医学教育向全国辐射的中心，中外儿科学术交流的重要桥梁。医院院训：团结、奋进、严谨、创新。

几十年来，儿科人本着 “尊重、平等、热情、关爱 ”的服务理念，发扬 “勤奋、创业、团结、奉献 ”的医院精神，以医院文化建设和精神文明建设为抓手，凝聚人心，营造规范有序、和谐稳定的良好氛围，在提供该质量的优良的医疗服务的同时，开展形式多样的社会公益活动，在全国享有较高的声誉。

医院高度重视对外学术交流和合作，努力构建儿科医学国际交流的桥梁。立足内涵质量建设，拓展交流合作机会，先后与美国费城儿童医院和加拿大BC儿童医院等20个国际上知名的医学机构建立了友好协作关系。