医院拥有核磁共振，体外冲击波碎石机，肌电图机，数字胃肠机，六排螺旋CT诊断仪，彩色B超，电子支气管镜，胆道镜，骨科关节镜，心内科运动平板，血液透析机，体外循环机，腹腔镜，前列腺电切镜，宫腔镜，热疗机，全自动生化仪，全自动血球计数仪，手术显微镜，眼科超声乳化仪，耳手术显微镜，电子胃镜及中科院万倍显微镜等大型医疗设备医疗网站，福建省南平市第二医院官网，www.np2y.com，医院专业科室设置齐全，设有内一（心血管，肾内），内二（神经，内分泌），内三（呼吸，血液，中毒，风湿及综合内科），内四（老年病，内分泌，中西医结合），内五（肿瘤防治），内六（消化），外一科（基础外科，肝胆外科），外二科（神经外科，泌尿外科），外三科（骨科），妇科，产科，儿科，耳鼻喉，眼科，口腔，麻醉，急诊科，康复医学科，ICU，血透室及皮肤，肛肠，药剂，放射，检验，病理，健康体检站，内镜，超声影像科等20多个临床医技科室。其中耳鼻喉，眼科，妇产，神经内外科，心血管内科，骨科及老年科为特色专科