京都大学则以培养科学家见长。在科学研究方面，人才和成果都不少，因而被人们称为“科学家的摇篮”。特别引以自豪的是，在1949～1987年的38年中，日本获诺贝尔奖的7名得主中京都大学就占4名（又有人说是四个半）。获日本文化勋章和日本科学院奖以及其他方面奖励的更是数不胜数，这些成就的取得同它的优秀传统是分不开的。 自由的学习气氛和严谨的学风并不矛盾，学校始终认为：学习是自愿自觉的行动，要靠自己的责任感和不懈的努力，京都大学的特色就是要培养具有独立思考和判断能力的人。因而在这种学术氛围里用不着担心这种“过分”的弹性会导致放任自流。事实上，在京都大学要想拿到学位要比其他学校困难得多。