出版社下设行政总编办公室，编辑部，船舶编辑室，出版科，发行科，教材供应中心，音像设计部和读者服务部八个部门。我社拥有专业门类基本齐全，梯次完整的编辑队伍，在编43人。有专职编辑24人，其中高级职称7人，中级职称12人。具有本科学历者占全社人数的95%。20年过程中，在出版社改革方面的措施。根据不同的岗位，不同情况分别实行了岗位责任制，目标管理责任制和承包责任制，先后制定了出版社生产经营财务管理办法和出版社改革方案，以及一系列的生产经营和管理办法，极大地调动了职工的积极性和创造性，使图书规模和数量大大增加，进一步扩大了出版社的积累，真正做到了以书养书，以社养社。并在有了一些盈余的情况下，出版社主动出资设立了教材专著教育网站，哈尔滨工程大学出版社,网站，press.hrbeu.edu.cn，建社20年来，始终贯彻党的出版方针，坚持正确的政治方向，特别是近几年来，坚持把社会效益放在第一位，本着为教学，科研服务，为国防工业服务的宗旨，已逐步形成了以船舶与海洋工程，自动控制，电子工程，机械工程化学工程和建筑工程等学科专业的教材，学术著作，工具书，参考书出版为主，自然科学基础，素质教育，外语教学，计算机科学，科普读物出版为辅的出版格局，形成了学科覆盖较广，教材比例较大的特色。截止目前，已出版了舰船现代化系列，国防特色教材系列，高等学校自动化系列，新世纪机械系列，电工电子规划系列，大学外语系列，现代应用经管系列等方面的图书2500余种，其中有多个系列的教材教辅和科技图书在国内，省内具有一定影响，为我国的图书出版事业做出了应有的贡献。在船海类专业图书的市场开发上，分阶段，有层次突出重点学科，在该领域内堪称国内一流