医院拥有西门子双排螺旋CT、DR、移动X光机、全自动生化分析仪、血气分析仪、电子胃镜、纤维支气管镜、心腹两用彩超、脑彩超、高档呼吸机（14台）、心电监护仪（35台），等一批先进的医疗设备，医疗科研提供了保障。

医院建于1953年，2003年7月，菏泽市委、市政府为加强我市传染病救治工作，在原结核病医院的基础上改扩建为菏泽市传染病医院，属财政全额拨款事业单位。医院的建设和发展得到了历届市委、市政府和市卫生局等各级领导的高度重视和大力支持，医院拥有一批优秀的传染病救治专家，在长期的发展过程中，形成了独特的医院文化和优良传统，逐步形成了自己的团队规范。

医疗服务质量是医院永恒的主题。医院始终将医疗质量，医疗安全和提升医疗服务水平作为工作的重中之重。医院建立了院、科二级医疗质量管控体系，显著提高了医院质量。病人满意度逐年提高，有效减少了医患纠纷的发生。

医院注重科学研究，近5年来，先后获得市级科技进步奖50项，在国家级和省级发表论文300多篇。医院承担着全市传染病的重症救治任务，为做好各类传染病的救治工作，医院内部注重技术练兵，努力打造一支能打硬仗，能打胜仗的救治团队，随时应对突发传染病疫情。在抗击非典，甲流感，击退手足口病等重大突发事件中，发挥了重要作用，在2009年抗击手足口病工作中被市委市政府授予集体 “二等功 ”。

建院60年来，传染病院人以执着的意志，严谨的学风，精湛的医术和高尚的医德书写了辉煌的历史。今天的传染病院人正为铸就一流的传染病医院，书写着新的篇章。

医院的各项工作赢得了各级领导和社会各界及患者的认可，先后荣获 “全国结核病防治工作先进单位 ”、 “全国百姓放心传染病专科示范医院 ”、 “山东省富民兴鲁劳动奖状 ”、 “山东省诚信医疗卫生单位 ”、 “山东省爱国卫生先进单位 ”等几十项荣誉。2009年4月19日陈竺部长来医院视察，对陪同的王随莲副省长，包文辉厅长说： “这个医院在省里都是很好的，在全国也是很好的，是全国的模范病房。 ”

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