新站房建设充分体现了一切以旅客为中心的理念。站房东西长270米，南北进深53。5米，地下1层，地上3层，站房总建筑面积41000平方米，是原站房面积的6倍。客流高峰期每小时可容纳1万名旅客候车，比原站候车能力增加4倍。售票大厅设有32个售票窗口和8个应急售票窗口，票厅面积1155m2。站房一层西端为行李房，中部为售票大厅，东端为软席贵宾候车区，二层为进站大厅，普通候车室，母婴，军人，158（要我帮）工作室等专用候车室，三层为普通旅客候车室。为方便旅客在各层之间的衔接，车站共安装各类电梯32部，其中自动扶梯18部，自动代步电梯4部，垂直升降梯10部（7部残疾人电梯，3部货梯）新建成的站房外型采用法国AREP公司的设计方案，内部功能采用铁道第四勘察设计院的设计方案，充分体现了标志性，功能性，系统性，先进性和文化性的有机结合。车站站房采用桅杆斜拉索悬挂结构，用18根桅杆支撑起横向钢梁，象一艘竖起桅杆，拉满风帆的巨型帆船停泊在美丽的玄武湖畔，既具有江南文化特色，又融合现代化气息