2001年，南京银行吸收国际金融公司（IFC）投资入股，持股比例为本行股份总额的15%，为当时城市商业银行引入外资的最高比例。2005年10月12日，南京银行与法国巴黎银行（BNP Paribas）签署战略联盟合作协议。法国巴黎银行持有南京银行19.2%的股份（上市后为12.61%）。南京银行与巴黎银行“业务合作协议”中明确了双方合作的主要业务领域包括零售银行、资本市场、消费信贷、财富管理、风险管理、信息技术、组织机构以及财务与人力资源等八个方面。此外，2006年12月12日，南京银行参股日照市商业银行18%的股份，成为其第一大股东。成为城市商业银行中对外参股金融机构的先行者。2007年7月，南京银行成功在上海证券交易所上市，作为在上海主板上市的第一家城商行，南京银行在资本市场上表现不俗，2008年获中国《银行家》杂志“最佳公司治理奖”，在《证券市场周刊》2008年上市银行综合实力排行榜中名列第一，08年末净利润增长率在国内14家上市银行中名列第四。

服务中小企业是南京银行的显著特色。南京银行专门成立小企业金融部，根据小企业需求，推出了“金梅花‘易’路同行”品牌，同时推出创易贷等5个系列30多个产品，覆盖了小企业各方面的融资需求。

打造个人业务品牌是南京银行重点业务战略方向，南京银行“优化网点结构、改善网点形象、提升服务能力”，赢得大量客户的信任。针对客户的多样化需求，推出了多种个人按揭贷款、储蓄新品。自行开发的“聚”系理财产品，以其稳健投资著称，获市场广泛赞誉并得到监管部门好评。

南京银行是一家债券特色银行，是全国首家开办结算代理业务试点行、全国首批双边报价商和结算代理人、全国首家开办人民币理财业务的城市商业银行，首批SHIBOR报价行之一。08年11月我行获得财政部储蓄国债试点资格，成为储蓄国债第二批试点的八家银行之一。

南京银行积极进行综合化探索，自参股日照市商业银行后，又参股江苏金融租赁有限公司，为大力推进社会主义新农村建设，涉足农村金融，筹建村镇银行，参股城商行，通过综合化经营，满足客户多样化需求，为南京银行可持续性发展打下坚实基础！成立十余年来，南京银行秉承“加快发展”的理念，对外抢抓市场机遇，对内不断提升管理水平，经营业绩连年大幅增长，取得了跨越式的发展。截至2009年6月末，全行资产总额为1293亿元，各项存款余额为937亿元，贷款余额为599亿元。2009年，我行在英国《银行家》杂志发布的年度全球1000家大银行排名名单中位居第366位