现在，美国国家科学基金会与美国的两千多所学院，大学，中小学教育机构，企业，非正式科学组织和其他的研究组织达成合作协议。美国国家科学基金会对一些个人和团队代表提出的倡议进行审核，为研究领域的可行项目拨款。跨学科的提议也可以纳入美国国家科学基金会考虑的范围。美国国家科学基金会的款项接收人是从提议发起人中选择的，他们可以为特定的项目申请美国国家科学基金会的赞助。美国国家科学基金会网站会定期发布一些赞助项目，申请人可以针对这些拨款项目提出倡议。这些赞助机会一般可分为三种，一种是项目描述，第二种是项目声明，第三种是项目合法化。这些都是美国国家科学基金会用来提出集资倡议的机制。

美国国家科学基金会的主要任务是确定国家科学基金会的政策。国家科学委员会按学科建立各种委员会，另外根据研究某种特殊问题的需要，建立一些特别委员会。1968年以后，国家科学基金会每年要通过国家科学委员会向总统  (  并转国会  )提交一份关于美国科学及其各学科发展情况的报告。  美国国家科学基金会的计划分为基础研究计划、科学教育计划、应用研究计划、有关科学政策的计划、国际合作计划5类。它以这些计划实施各项职能。

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