1953年后，随着国家进入有计划的经济建设时期，上海九三组织、推动社员为社会主义经济建设服务，并在工作中加强自身建设，巩固和发展组织，到1957年7月，上海九三社员已从解放初的26人增加到1454人。

民国35年5月，国民党政府返都南京，各民主党派人士云集上海。是年春，在重庆的九三学社社员陆续抵达上海。6月，九三学社领导人许德珩来沪，与社员共商社务，并于6月12日成立九三学社上海分社（简称上海九三）。由此，在总社领导下，分社投入反对内战，要求和平；反对独裁，争取民主；反对美国扶植日本（简称反美扶日）和解放上海等各项爱国民主运动。

1989年底，__中央发表《关于坚持和完善中国__领导的多党合作和__协商制度的意见》（以下简称《意见》），确定民主党派的参政党地位，制订民主党派参政的基本点及监督的总原则。上海九三各级组织及全体社员在《意见》的指导下，进一步增强了参政议政、民主监督的意识，发挥社员人才荟萃的综合优势，就改革开放和经济建设等有关问题，开展专题调研，出谋献策。许多社员在各自工作岗位上取得了不同程度的成就，不少人获得了荣誉，有11位社员当选为中国科学院院士，6位社员当选为中国工程院院士。

1978年底，__十一届三中全会重新确定了解放思想、实事求是的思想路线，在统一战线工作上，大力进行拨乱反正，全面落实各项统战政策，所有在 “文化大革命 ”中和之前因 “左 ”的影响而受到错误处理的九三学社社员，经过复查得到平反改正，落实了政策，大大地调动了社员为经济建设服务的积极性。1979年后，按照九三学社中央 “坚持发展与巩固相结合的方针 ”和 “发展为了工作，在工作中发展 ”的原则，上海九三加强组织建设与思想建设，健全领导班子，并把工作重点转移到为经济建设服务的轨道上来。自80年代起，在现代化建设和改革开放的新时期，上海九三充分发挥科技人才集中的优势，在参政议政，献策的同时，开展了科技咨询、智力支边、医学专家门诊、医学讲座、社会办学和对外联络等工作，参与了浦东新区开发开放，为上海的振兴和发展作出新的贡献。