石河子大学始终坚持立足兵团，服务新疆，面向全国，辐射中亚的办学定位，以培养高素质复合应用型人才作为根本任务，稳步发展本科教育，大力发展研究生教育，积极推进留学生教育，构建了多样化，高素质，强应用，重创新的人才培养体系。先后培养各类毕业生近10万人，为兵团和全国农垦系统培训各类管理和专业人才近20万人。学校成为屯垦戍边，建设边疆的重要力量，涌现出了拥有百姓教授称号的全国模范教师代江生教授和被胡锦涛总书记誉为为人师表，品德高尚的全国模范教师孟二冬教授（北大支教老师）石河子大学建校最早的原石河子医学院前身诞生于1949年9月中国人民解放军解放新疆的进军途中。1996年4月，学校由农业部部属的石河子农学院，石河子医学院，兵团师范专科学校和兵团经济专科学校合并组建。在长期办学历程中，学校始终与祖国同呼吸，共命运，党中央，国务院高度重视和关心学校发展，多次提出加大对石河子大学的支持力度。周恩来总理，陈毅副总理，贺龙副总理，王震副主席等党和国家领导人曾亲临学校视察，近年来，李岚清，刘延东，陈至立，周济，袁贵仁等领导相继视察学校，学校的发展建设得到了党中央，国务院各级领导的亲切关怀，成为植根祖国西北边疆的一颗璀璨明珠