1962年巴登-符腾堡州政府提议在乌尔姆建立一所医学院，1965年7月乌尔姆大学工作圈向巴登-符腾堡州政府提交了关于创建乌尔姆医学和自然科学大学（Medizinisch-NaturwissenschaftlicheHochschule）的报告，1966年1月获得了批准，筹建阶段也曾有过创建综合性大学的设想，但是由于专业范围限制未能实现。1967年2月25日，乌尔姆医学和自然科学大学正式成立，同年7月4日被授予综合性大“文体教育，大学”乌尔姆大学首页，乌尔姆大学是德国巴登-符腾堡州的第9所大学，创建乌尔姆大学的设想要追溯到20世纪50年代。1959年德国开始筹备组建一批新的大学，乌尔姆大学工作圈随后在1961年3月提出了创建乌尔姆大学的设想，由于当时乌尔姆与巴登-符腾堡州的另一个城市康斯坦茨处于相互竞争的状态，两个城市都在筹备建立大学，而乌尔姆人发现医科将是未来乌尔姆大学的一个很好的选择和优势，因为对于竞争的另一方康斯坦茨来说，由于它地处德国边境，就医的病人不多，康斯坦茨的医科毕业生将很难获得就业机会。正因为如此，乌尔姆大学的创建设想集中到了以医学和自然科学为特色