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厦门市科协的前身是 “厦门市自然科学专门学会联合会 ”筹委会(简称厦门市科联筹委会)和 “厦门市科学技术普及协会 ”(简称厦门市科普协会)。1958年12月厦门市科联筹委会和厦门市科普协会正式合并成为厦门市科学技术协会(简称厦门市科协)。

厦门市科协是中国科协、福建省科协的地方组织，业务上接受中国科协、省科协的指导。厦门市科协所属的自然科学专门学会（协会、研究会）有72个，包括理、工、农、医和交叉五个学科和科普性团体，拥有个人会员近2万人。厦门7个区均成立区科协，有23个工厂企业也先后建立了厂科协。形成一个学科比较齐全、遍及城乡的群众性学术交流、科学普及网络。

厦门市科协第三次代表大会1986年12月召开，代表471人，第三届科协主席蔡启瑞；

厦门市科协第二次代表大会1981年9月召开，代表300人，第二届科协主席李来荣；

团结和动员科学技术工作者以经济建设为中心，坚持科学技术是第一生产力的思想，实施科教兴国和可持续发展战略，促进科学技术的繁荣和发展，促进科学技术的普及和推广，,促进科学技术人才的成长和提高，促进科学技术与经济的结合，为社会主义物质文明和精神文明建设服务，反映科学技术工作者的意见，维护科学技术工作者的合法权益，为科学技术工作者服务。

3、开展科技干部的继续教育和技术培训、更新知识。

宗旨

2、做好科普工作，普及科学知识，促进我市青少年、城乡干部群众和各级领导干部科技素质的提高。

7、对所属市级学会、协会、研究会进行管理，对区科协，厂科协等基层科协进行业务指导。

6、表彰奖励优秀科技工作者，举荐人才，参与科技政策法规的制定，反映科技工作者的意见和要求，维护科技工作者的合法权益。