医院临床科室有，骨与关节疾病中心（骨科，矫形外科），心脏疾病中心（心内科，心外科，心脏介入，电生理检查室，心脏超声），呼吸疾病中心（呼吸内科，胸外科），消化疾病中心（消化内1科，消化内2科，普通外科，微创外科），神经疾病中心（神经内科，神经外科，神经介入科），泌尿疾病中心（泌尿外科，肾内科，血透室），妇儿中心（妇科，乳腺科，产科，儿科），血管疾病中心（内分泌科），头颈疾病中心（耳鼻喉科，眼科，口腔科），急救医学中心（急诊内科，急诊外科，急诊骨科，重症医学科），感染疾病中心（发热门诊，肝炎门诊，肠道门诊，药房，检验，放射，隔离病房），中医学中心（中医科，针灸科），皮肤疾病中心（皮肤科），麻醉医学中心（麻醉科，手术室医疗网站，北京市垂杨柳医院，www.cylh.com，2004年医院确立了将微创作为医疗服务特色品牌，申办大学附属医院的发展目标，医院打破传统内科，外科界线，组建临床医学中心17个和医技中心4个，二级科室共46个，逐步形成医生围着病人转方法根据病情选的中心化医疗服务模式，力争使患者在最短时间内，得到内，外科医生共同参与的综合性服务，根据患者的病情制定恰当的诊疗方案，努力使患者得到损伤最小，疗效最佳的治疗