学校有30个本科专业和1个七年制本硕连读专业，涉及医学、理学、工学、管理学、文学、法学、教育学等七大学科门类。学校为教育部首批批准的我国招收本科临床医学专业（英语授课）留学生的高校之一，现有学历教育留学生370余人。目前学校有全日制在校生11900余人（不含独立学院——温州医学院仁济学院），已形成从本科生到硕士生、博士生及博士后，从全日制到成人教育、留学生和港澳台学生教育全方位、多层次的人才培养体系。现有教职员工及医护人员约8000人（包括各直属附属医院），其中具有高级专业技术职务的有1200余人。学校本部现有专任教师950余人（不含独立学院——温州医学院仁济学院），其中具有正高级专业技术职务的201人，具有副高级专业技术职务的241人。一批优秀教师入选国家“千人计划”、“长江学者奖励计划”、国家“百千万人才工程”、教育部“新世纪优秀人才支持计划”、浙江省特级专家、省“百人计划”、省高校特聘教授、省“151人才工程”、省有突出贡献的中青年科技人员、省高校中青年学科带头人。

“十一五”以来，学校获批国家特色专业建设点3个、国家级教学团队1个、国家级人才培养创新实验区1个、国家级实验教学示范中心1个、国家级精品课程3门、国家双语教学示范课程1门、省重点（建设）专业10个。近年来，在教学成果评奖中，获国家级教学成果二等奖2项、省级教学成果奖一等奖3项。在历年全国临床执业医师资格考试中，学校毕业生的成绩在全国百余所设有临床医学类专业的高校中一直处于前10%之内。

“十一五”以来，学校承担省部级以上科研项目350多项，其中国家级科研项目110多项，科研成果获得省部级以上奖励30余项，其中获国家技术发明奖二等奖1项、国家科技进步二等奖2项、中华医学科技奖一等奖1项、中国药学会科技奖一等奖1项、浙江省科学技术奖一等奖3项。

学校积极推进教育国际化，与18个国家（地区）的58所高校、教育科研机构建立了良好的交流合作关系，开展包括互派学者、联合培养博士生、互派留学生、合作研究等各种形式的合作项目。分别与泰国东方大学、纽约州立大学合作成立了孔子学院。

学校现有3个校区，总占地面积1290多亩，校舍建筑面积49万多平方米。图书馆文献128万册。学校主办、编辑出版5种学术期刊、1种学术报刊，其中3种期刊入选“中国科技核心期刊”，《中华眼视光学与视觉科学杂志》为中华医学会系列杂志。学校拥有5所附属医院，其中4所为三级甲等医院，同时在浙江省各地设有11所非直管附属医院（临床学院）。

学校的发展定位是：以本科生教育为主，积极发展研究生教育；以医学学科为重点，多学科协调发展；服务浙江，面向全国；办学特色鲜明，在国内外有一定影响的开放型、教学研究型大学。学校是全国首批硕士学位授予单位，具有博士学位授予权。现有外科学、妇产科学、眼科学3个博士点，临床医学、中药学2个一级学科硕士点，28个二级学科硕士点，有临床医学硕士、口腔医学硕士和工程硕士专业学位授予权，设有临床医学一级学科博士后科研流动站。现有1个省部共建国家重点实验室培育基地、8个省部级重点实验室（研究中心），4个浙江省“重中之重”重点学科、10个浙江省重点学科